黄淮学院农业种质资源研究所围绕现代农业发展需求，以驻马店市农业种质资源为基础，以种质资源收集保护利用为核心，强化学科交叉融合、人才队伍整合和科技人才资源共享，力争形成从种质资源收集保护、鉴定评价，到农作物栽培技术优化、优良新品种选育及农产品加工利用的技术体系，为驻马店现代农业发展提供科技支撑。

农业种质资源研究所依托于驻马店产业创新发展研究院，与黄淮学院生物与食品工程学院、驻马店种子管理站、驻马店农校及驻研种业有限公司等单位加强合作，实现人才共享、资源共享，更好的服务驻马店现代农业发展。研究所与河南省农科院、河南农业大学、华中农业大学等科研单位及院校建立密切的合作交流关系，有利于改善研究条件，加强学术交流，提高科研水平。

研究所现有成员12人，其中教授5人，博士6人。承担和参与各类科研项目60余项，授权发明专利30余项，发表SCI论文100余篇。